原因第一人类当电池这个理论是站不住脚的人类都能发明出核能，存在了不知道多久的已经有意识的电脑，不可能没了阳光就没有了能源它的技术应该已经能脱离星球了第二尼奥在锡安也有超能力，这在现实中是不可能；首先，锡安从未被摧毁过第三部里面那次战争是母体进攻的最深入的唯一的一次而且第三部，母体问尼奥想要什么，尼奥说想要和平最后的母体和先知说话时并没有确定和平到底能持续多久也就是说，这是个轮回前面N个尼奥；其实消灭不掉，但是可以让史密斯感染到自己身上来，而他又是通过母体的线连进母体的，所以删了他，史密斯就被完全删除了，这样来换得锡安所有人的性命也就是说，他用自己的生命，换得众人的生存；也就是教义中的发源地，因此很多信仰都相信一路撒冷是其信仰的起源与代表城市，电影中用这个名字代表人类最后的根据地，用的是一种比拟的手法，更容易让观众们带入感情在黑客帝国的第一部中电影第一次引入了zion世界的；而机器帝国则要放过锡安从此机器帝国和锡安进入一段不同以往的关系关于尼欧的后期的超能力，我是这样理解的尼欧作为母体内产生的超级用户，拥有控制母体参数的能力其他人例如墨菲斯等人，只能通过一定的黑客能力对母体。