最近看了黑客帝国123相信我，看完你就更懵了按照剧情设定，尼奥当时没在锡安也没有在矩阵里边，而是处在了中间地带，是个车站还遇见了两个控制程序以及他们的孩子所以尼奥进入母体的时候是真人设定进入的，在里面就。
尼奥在第二部造物主房间就明白了所有，但是他不得不选择牺牲，最后的和平只是暂时的，随着母体bug例如白色双子星一类的超能者越来越多，还会有尼奥出现，然后像个木偶一样继续被牺牲，手打完毕。
根据上部影片的结局来看，救世主复活绝非偶然尼奥的躯体并没有被毁灭，预示着尼奥终究会复活卷土重来，为后面的人类与电子机械大战的开展作铺垫二黑客帝国4救世主复活，承上启下前情回顾，在人机博弈过程中，史密斯被。
值得一提的是，虽然目前还没有明确的消息表明，黑客帝国4会有怎样的故事，因为到目前为止，这部电影的故事仍然是一个迷，尽管电影会以某种方式，涉及到原版人马的回归，尤其是对于尼奥来说，因为他在第三部电影中牺牲了。
由于战力相差悬殊，眼看人类就要灭族，救世主尼奥the One以彻底清除史密斯变异病毒为条件，要求机器大军撤军，与人类维持和平尼奥自认为最终与机械达成共识，在母体内部与史密斯发生激烈战斗最终尼奥选择了自我牺牲，清除了。
对于尼奥一方，特工的目的成了尼奥与矩阵谈判的唯一砝码，所以尼奥被矩阵重新改造，帮助矩阵用同归于尽的方式杀死特工，矩阵则不在毁灭锡安也就是说矩阵并不是万能的，也有他控制不了的情况，而且有过好像是4次控制不了。