The Oracle Well， come on I ain#39t gonna bite ya Come around here， and let me have a look at ya My goodness， look at you！ You turned out all right， didn#39t you？ How do you feel？Neo I。
史密斯在剧情中，类似一个叛逆的程序，就像病毒一样可以无限复制，母体无法对其进行控制就像我们的电脑系统，无法独立直接删除病毒一样而在大结局中，尼奥和史密斯中和，成为母体可控的程序，同时利用删除程序将母体和自身全部。
尼奥的选择终结了矩阵升级锡安毁灭重建的循环，但却迎来了另一个问题，如果尼奥不进入代码之源，那么架构师就会亲自毁灭人类先知为此改造了“特工”史密斯使之成为一个类似病毒的非法程序存在，这点从先知和尼奥的对话中可以。
“尼奥，你曾经作过这样的梦吗，你坚信不移的东西都是真的吗你能从那样的梦中醒来吗你能分辨出梦境与现实世界的区别吗”尼奥不顾一切地想追寻“矩阵”的真相，他在梦中总是听到关于它的耳语，这是一种神秘的不。
大意是锡安不是一个真实的城市，它是由一个比母体更高级的系统控制的虚拟世界，用来安置那1%反抗母体控制的人类的意识尼奥也不是真正的人类，他是母体中无数 不可避免的异常程序的集合体，也就是一个大Bug而造物主。
先知想要终结机器与人类的战争并因此创造出了尼奥和史密斯最终一战尼奥与史密斯融合分解了，架构师也履行对尼奥的承诺允许那1%的人类永久的生存在锡安中，先知的矩阵革命得以实现最终先知和尼奥共同拯救了人类。