因为他是救世主，可以掌控自己的命运，可以自己选择生死，即使他中枪了，别人给他的程序激活，就可以再次复活。
SMITH说不公平是因为他明明杀死了NEO，结果却因为自己的代码被主机获得而导致要被删除，所以才说不公平NEO死了，最后可以看到他被机器带走了设计师是创建母体的人，而先知，她自己也说了，她是为了破坏平衡，她就是为了。
1为什么“先知”和“造物主”这些电脑程序都没消失没有消失，因为作为救世主的尼奥并没有消灭源程序即造物主而是跟它达成一个协议，尼奥用自己的生命去帮助造物主消灭已经无法控制的史密斯，而造物主不再攻击锡安的人类。
